申请设置使用配备有多台业余无线电发射设备的业余无线电台，应该：

在业余无线电管理中，“电台”与“设备”是两个不同的概念。电台呼号是指配给整个业余电台的唯一标识，不论该电台配备了多少台发射设备（如同时拥有手台、车台和短波电台），都只视为一个业余电台并共用这一个呼号。这直接排除了认为“一机一呼号”的选项C。 为了保障无线电频段的安全和规范使用，无线电管理机构必须对电台的实际发射能力进行全面监管。因此，该电台所配备的每一台发射设备，都必须经过核定，并将型号、序列号、发射频率和功率等参数详细载入《业余无线电台执照》中，未经载明的设备不得用于发射。 选项B和选项D试图只核定部分设备（如仅核定一台或按频段核定），这违反了所有发射设备均须备案核准的法规要求。只有全部发射设备都核定并载入执照，才是合法合规的操作（选项A）。