我国专门针对业余无线电台的管理文件及其制定机构分别是：

我国目前专门针对业余无线电台进行管理的现行有效部门规章是《业余无线电台管理办法》。该文件由我国的无线电主管部门——工业和信息化部（简称工信部）负责制定并发布。因此，选项 A 和 C 是正确的组合。 选项 B 提到的《业余无线电台管理暂行规定》是一份历史文件（1992年发布），自2013年《业余无线电台管理办法》正式施行后就已经废止，不能再作为当前的专门管理文件。 选项 D 的“国务院”是我国最高国家行政机关，其颁布的是层级更高的综合性行政法规（如《中华人民共和国无线电管理条例》），而专门针对“业余无线电台”的具体管理文件属于部门规章，由工信部制定而非国务院直接制定。